Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN6Q9NWW5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms