Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms