Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms