Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms