Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP7BPQ9NSQ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP7BPQ9NSQ0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms