Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms