Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms