Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms