Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms