Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms