Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms