Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NXF3Q9H4D5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXF3Q9H4D5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms