Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms