Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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MS4A6AQ9H2W1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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MS4A6AQ9H2W1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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MS4A6AQ9H2W1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A6AQ9H2W1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A6AQ9H2W1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A6AQ9H2W1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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