Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL4Q9C0H6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms