Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms