Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms