Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms