Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSPO3Q9BXY4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms