Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC106Q9BWC9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms