Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms