Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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