Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TM2D3Q9BRN9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TM2D3Q9BRN9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TM2D3Q9BRN9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TM2D3Q9BRN9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TM2D3Q9BRN9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TM2D3Q9BRN9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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