Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CPPED1Q9BRF8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms