Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPIFA3Q9BQP9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms