Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms