Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms