Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRERF1Q96PN7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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