Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OPALINQ96PE5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms