Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms