Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms