Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2Q96I99 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms