Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPNQ96H22 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms