Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms