Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms