Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPUSD4Q96CM3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD4Q96CM3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms