Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3Q969T4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms