Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms