Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms