Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALLDQ8WX93 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms