Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms