Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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ZNF548Q8NEK5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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