Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CNNM3Q8NE01 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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