Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms