Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms