Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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