Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms