Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF23Q7RTU1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms