Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms