Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 510.21□□□□□ -0.776e-7■■■■■ 34.3
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PRPF8Q6P2Q9 TTC3-220ENST00000487711 925 ntTSL 51.53□□□□□ -2.163e-6■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 TTC3-205ENST00000411496 893 ntTSL 30.87□□□□□ -2.273e-6■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 NF1-216ENST00000495910 8223 ntTSL 23.8□□□□□ -1.82e-8■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 DCTN5-206ENST00000566298 744 ntTSL 46.11□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 34.2
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PRPF8Q6P2Q9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 34.2
PRPF8Q6P2Q9 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 34.2
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PRPF8Q6P2Q9 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 34.2
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PRPF8Q6P2Q9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TM2D2-208ENST00000522142 885 ntTSL 314.7□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TCP11L1-203ENST00000527661 2468 ntTSL 514.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.094e-9■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 REEP2-203ENST00000464751 553 ntTSL 414.23□□□□□ -0.134e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ALKBH1-204ENST00000557057 1750 ntTSL 314.22□□□□□ -0.134e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-9■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 REEP2-210ENST00000512126 572 ntTSL 413.75□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 34.1
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